宗教信仰是苗族人和土家族人在長期的生産生活中累積出來的，其中苗族人主要信仰自然崇拜和圖騰崇拜，而土家族人則信仰祖先崇拜等。對于來說，苗族人更加迷信鬼神和盛行巫術。這也是爲什麽出現了趕屍、降頭術等壹系列巫術文化。

 

苗族對壹些巨形或奇形的自然物，往往也會認爲是壹種靈性的體現。因而還會對其頂禮膜拜，甚至酒肉祭供。其中比較典型的自然崇拜物有巨石、怪石、岩洞、大樹等。除了這些以外，苗族還認爲壹些自然現象或自然物具有神性或鬼性。所以也就出現了在苗族的語言中，神和鬼基本上是同壹個音，造成鬼神不分，兩詞並用。多數情況下，鬼被認爲是被遺棄或受委屈的靈魂和工具所變成的，常給人類帶來災難、病痛、瘟疫或其他不幸。而有靈性的自然現象常被認爲是善鬼，具有壹定的神性，如山神、谷魂、棉神、風神、雷神、雨神、太陽神、月亮神等。對于善鬼、惡鬼，苗族人的祭祀之法亦不同。苗族人對善鬼有送有迎，祭祀較真誠，而對于惡鬼則須賄賂哄騙直至驅趕使之遠離。

除了這些以外，苗族人還認爲自然界中就存在許多精怪。比如牛在廄內以糞便蓋身或在廄內打轉；豬吃豬仔或躺在食槽裏；鴨吃鴨蛋；老虎進田；遇到兩蛇交尾；母雞發出公雞的鳴叫等均屬出現了相應的精怪。這時候壹般要采取相應的措施，以免災禍上身。

 

在圖騰崇拜方面，許多苗族崇拜盤瓠（壹種傳說中的神犬）。他們世代傳說著“神母犬父”的故事，把盤瓠視爲自己的始祖。而還有壹些苗族認爲他們的始祖姜央起源于楓木樹心，因而把楓樹視爲圖騰。另有更有壹些地區的苗族以水牛、竹子等爲自己的圖騰崇拜對象。

土家族中，祖先崇拜在社會中占有十分重要的位置。他們認爲祖先雖然死去，其靈魂卻永遠與子孫同在，逢年過節必以酒肉供奉，甚至日常飲食也要隨時敬奉祖先。許多地區定期或不定期地舉行祭祖盛典，其中，黔東南的吃牯髒至今盛行不衰，最爲典型。吃牯髒亦稱祭鼓節、鼓社節、鼓藏（牯髒）節，以宗族（鼓社）爲單位，每七年或十三年舉行壹次。他們認爲祖先的靈魂寄居中在木鼓裏，祭鼓就是敲擊木鼓召喚祖先的靈魂來享用兒孫的供品。主祭者稱爲牯髒頭，而祭品用的牛也是專門爲此而飼養的，並非壹般的牛。

 

除了以上這些原始的信仰之外，自近代以來，隨著西方和其他壹些地方的傳教士深入我國內地傳教，在少部分地區的壹些群衆，還信仰起了基督教。不過隨著現在的全國民族大融合，很多風俗已經漸漸的消失了。